Date de modification : 27/02/2014 | Version : 1 | ID : 8214
Général | |
Identification | |
Nom détaillé | Annotator®, Base de données du Programme "Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT)® " |
Sigle ou acronyme | Annotator® |
Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.) | Accord CNIL - No 1381614 |
Thématiques générales | |
Domaine médical |
Cancérologie |
Déterminants de santé |
Addictions et toxicomanie Génétique Mode de vie et comportements Produits de santé |
Autres, précisions | cancers |
Mots-clés | Ligue Nationale contre le Cancer; altérations, génome, réarrangements chromosomiques, expression des gènes, microARNs, patterns de méthylation, exons, cellules cancéreuses, médecine personnalisée, mutations |
Responsable(s) scientifique(s) | |
Nom du responsable | Ayadi |
Prénom | Mira |
Adresse | 14 rue Corvisart |
Téléphone | 01 53 55 24 00 |
Mira.Ayadi@ligue-cancer.net | |
Laboratoire | CIT – Recherche |
Organisme | Ligue Nationale Contre le |
Nom du responsable | De Reyniès |
Prénom | Aurélien |
Téléphone | 01 53 55 24 00 |
Laboratoire | CIT – Recherche |
Organisme | Ligue Nationale Contre le |
Nom du responsable | Petel |
Prénom | Fabien |
Adresse | 14 rue Corvisart, 75013 Paris, France |
Téléphone | 01 53 55 24 00 |
Fabien.Petel@ligue-cancer.net | |
Laboratoire | CIT – Recherche |
Organisme | Ligue Nationale Contre le |
Collaborations | |
Participation à des projets, des réseaux, des consortiums |
Oui |
Précisions | Plus de 80 projets de recherche ont été menés dans le cadre du programme CIT, sur plus de 20 types de cancer différents, et ont conduit à de nombreuses publications dans des revues internationales. |
Financements | |
Financements |
Privé |
Précisions | CIT est un programme national de génomique des cancers, initié, financé et géré par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 2000 |
Gouvernance de la base de données | |
Organisation(s) responsable(s) ou promoteur | Ligue Nationale contre le Cancer (National League against Cancer) |
Statut de l’organisation |
Secteur Privé |
Contact(s) supplémentaire(s) | |
Caractéristiques | |
Type de base de données | |
Type de base de données |
Bases de données issues d’enquêtes |
Base de données issues d'enquêtes, précisions |
Etudes longitudinales (hors cohortes) |
Origine du recrutement des participants |
Via une sélection de services ou établissements de santé |
Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle |
Non |
Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon | Le programme CIT s’appuie sur un réseau national de chercheurs et cliniciens, en lien avec des plateformes technologiques. |
Objectif de la base de données | |
Objectif principal | Caractériser de façon exhaustive et combinée les altérations du génome à l’origine des cancers (mutations et réarrangements chromosomiques, expression des gènes et des microARNs, patterns de méthylation, variations des exons, etc.) CIT développe ainsi une vision intégrée du fonctionnement des cellules cancéreuses, et ces travaux constituent la base d’une médecine personnalisée, adaptée aux caractéristiques génomiques de chaque tumeur. |
Critères d'inclusion | Les critères d’inclusion sont spécifiques à chaque projet accepté dans le Programme CIT, et dépendent des questions biologiques et cliniques des porteurs de projet associés. Les études peuvent concerner des patients suivis en milieu hospitalier, ou des patients déjà inclus dans un essai clinique prospectif. Le consentement éclairé des patients a été obtenu auparavant. Les pathologies étudiées sont soit des tumeurs pédiatriques, soit des cancers de l’adulte, et peuvent concerner aussi bien des tumeurs solides que des hémopathies malignes ou des lymphomes. L’accès aux données est sécurisé, et restreint pour chaque projet aux investigateurs concernés. |
Type de population | |
Age |
Nouveau-nés (naissance à 28j) Nourrissons (28j à 2 ans) Petite enfance (2 à 5 ans) Enfance (6 à 13 ans) Adolescence (13 à 18 ans) Adulte (19 à 24 ans) Adulte (25 à 44 ans) Adulte (45 à 64 ans) Personnes âgées (65 à 79 ans) Grand âge (80 ans et plus) |
Population concernée |
Sujets malades |
Sexe |
Masculin Féminin |
Champ géographique |
National |
Détail du champ géographique | France |
Collecte | |
Dates | |
Année du premier recueil | 2000 |
Année du dernier recueil | 2014 |
Taille de la base de données | |
Taille de la base de données (en nombre d'individus) |
[10 000-20 000[ individus |
Détail du nombre d'individus | Fin 2013, la base de données ‘Annotator’ du Programme CIT contenait les informations histologiques, cliniques, biologiques de 11000 échantillons tumoraux (patients anonymisés), tous types de cancer confondus, et 18000 expériences haut-débit avaient été réalisées. |
Données | |
Activité de la base |
Collecte des données active |
Type de données recueillies |
Données cliniques Données paracliniques Données biologiques |
Données cliniques, précisions |
Dossier clinique |
Détail des données cliniques recueillies | -- |
Données déclaratives, précisions |
Auto-questionnaire papier Face à face |
Données paracliniques, précisions | expression de protéines; identification de mutations de génes (ABCB1, AKT1, APC, BCL2, BRAF, BRCA1/2, CCND1, CDKN2A, CTNNB1, EGFR, ERBB2, etc), de translocations connues (1p/19q) ou d'altérations (perte allélique basée des microsatellites, etc) |
Données biologiques, précisions | présence d'adénomes. Morphologie cellulaire, différenciation, fibroses, mitoses, nécroses. Pourcentage de cellules tumorales. Hyperplasie. AFP. Albumine. ALP. B2 microglobuline. Bilirubine. CEA. LDH. Metanephrine. PSA. Taux de sédimentation. Creatinine. Leucocytes. |
Existence d’une biothèque |
Oui |
Contenu de la biothèque |
Sang total Cellules sanguines isolées Tissus Lignées cellulaires ADN ADNc/ARNm Autres |
Détail des éléments conservés | Echantillons tumoraux |
Paramètres de santé étudiés |
Evénements de santé/morbidité Evénements de santé/mortalité |
Modalités | |
Suivi des participants |
Oui |
Appariement avec des sources administratives |
Non |
Valorisation et accès | |
Valorisation et accès | |
Lien vers le document | http://cit.ligue-cancer.net/?page_id |
Accès | |
Charte d'accès aux données (convention de mise à disposition, format de données et délais de mise à disposition) | L’accès aux données est sécurisé, et restreint pour chaque projet aux investigateurs concernés. |
Accès aux données agrégées |
Accès restreint sur projet spécifique |
Accès aux données individuelles |
Accès restreint sur projet spécifique |
Partenaires - F.A.Q. - Contact - Plan du site - Mentions légales - Administration - PEF-HD - Mis à jour le 15 décembre 2020 - Version 4.10.05