Annotator® - Annotator®, Base de données du Programme "Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT)® "

Responsable(s) :
Ayadi Mira, CIT – Recherche
De Reyniès Aurélien , CIT – Recherche
Petel Fabien, CIT – Recherche

Date de modification : 27/02/2014 | Version : 1 | ID : 8214

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Nom détaillé Annotator®, Base de données du Programme "Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT)® "
Sigle ou acronyme Annotator®
Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.) Accord CNIL - No 1381614
Thématiques générales
Domaine médical Cancérologie
Déterminants de santé Addictions et toxicomanie
Génétique
Mode de vie et comportements
Produits de santé
Autres, précisions cancers
Mots-clés Ligue Nationale contre le Cancer; altérations, génome, réarrangements chromosomiques, expression des gènes, microARNs, patterns de méthylation, exons, cellules cancéreuses, médecine personnalisée, mutations
Responsable(s) scientifique(s)
Nom du responsable Ayadi
Prénom Mira
Adresse 14 rue Corvisart
Téléphone 01 53 55 24 00
Email Mira.Ayadi@ligue-cancer.net
Laboratoire CIT – Recherche
Organisme Ligue Nationale Contre le
Nom du responsable De Reyniès
Prénom Aurélien
Téléphone 01 53 55 24 00
Laboratoire CIT – Recherche
Organisme Ligue Nationale Contre le
Nom du responsable Petel
Prénom Fabien
Adresse 14 rue Corvisart, 75013 Paris, France
Téléphone 01 53 55 24 00
Email Fabien.Petel@ligue-cancer.net
Laboratoire CIT – Recherche
Organisme Ligue Nationale Contre le
Collaborations
Participation à des projets, des réseaux, des consortiums Oui
Précisions Plus de 80 projets de recherche ont été menés dans le cadre du programme CIT, sur plus de 20 types de cancer différents, et ont conduit à de nombreuses publications dans des revues internationales.
Financements
Financements Privé
Précisions CIT est un programme national de génomique des cancers, initié, financé et géré par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 2000
Gouvernance de la base de données
Organisation(s) responsable(s) ou promoteur Ligue Nationale contre le Cancer (National League against Cancer)
Statut de l’organisation Secteur Privé
Contact(s) supplémentaire(s)
Caractéristiques
Type de base de données
Type de base de données Bases de données issues d’enquêtes
Base de données issues d'enquêtes, précisions Etudes longitudinales (hors cohortes)
Origine du recrutement des participants Via une sélection de services ou établissements de santé
Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle Non
Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon Le programme CIT s’appuie sur un réseau national de chercheurs et cliniciens, en lien avec des plateformes technologiques.
Objectif de la base de données
Objectif principal Caractériser de façon exhaustive et combinée les altérations du génome à l’origine des cancers (mutations et réarrangements chromosomiques, expression des gènes et des microARNs, patterns de méthylation, variations des exons, etc.) CIT développe ainsi une vision intégrée du fonctionnement des cellules cancéreuses, et ces travaux constituent la base d’une médecine personnalisée, adaptée aux caractéristiques génomiques de chaque tumeur.
Critères d'inclusion Les critères d’inclusion sont spécifiques à chaque projet accepté dans le Programme CIT, et dépendent des questions biologiques et cliniques des porteurs de projet associés. Les études peuvent concerner des patients suivis en milieu hospitalier, ou des patients déjà inclus dans un essai clinique prospectif. Le consentement éclairé des patients a été obtenu auparavant. Les pathologies étudiées sont soit des tumeurs pédiatriques, soit des cancers de l’adulte, et peuvent concerner aussi bien des tumeurs solides que des hémopathies malignes ou des lymphomes. L’accès aux données est sécurisé, et restreint pour chaque projet aux investigateurs concernés.
Type de population
Age Nouveau-nés (naissance à 28j)
Nourrissons (28j à 2 ans)
Petite enfance (2 à 5 ans)
Enfance (6 à 13 ans)
Adolescence (13 à 18 ans)
Adulte (19 à 24 ans)
Adulte (25 à 44 ans)
Adulte (45 à 64 ans)
Personnes âgées (65 à 79 ans)
Grand âge (80 ans et plus)
Population concernée Sujets malades
Sexe Masculin
Féminin
Champ géographique National
Détail du champ géographique France
Collecte
Dates
Année du premier recueil 2000
Année du dernier recueil 2014
Taille de la base de données
Taille de la base de données (en nombre d'individus) [10 000-20 000[ individus
Détail du nombre d'individus Fin 2013, la base de données ‘Annotator’ du Programme CIT contenait les informations histologiques, cliniques, biologiques de 11000 échantillons tumoraux (patients anonymisés), tous types de cancer confondus, et 18000 expériences haut-débit avaient été réalisées.
Données
Activité de la base Collecte des données active
Type de données recueillies Données cliniques
Données paracliniques
Données biologiques
Données cliniques, précisions Dossier clinique
Détail des données cliniques recueillies --
Données déclaratives, précisions Auto-questionnaire papier
Face à face
Données paracliniques, précisions expression de protéines; identification de mutations de génes (ABCB1, AKT1, APC, BCL2, BRAF, BRCA1/2, CCND1, CDKN2A, CTNNB1, EGFR, ERBB2, etc), de translocations connues (1p/19q) ou d'altérations (perte allélique basée des microsatellites, etc)
Données biologiques, précisions présence d'adénomes. Morphologie cellulaire, différenciation, fibroses, mitoses, nécroses. Pourcentage de cellules tumorales. Hyperplasie. AFP. Albumine. ALP. B2 microglobuline. Bilirubine. CEA. LDH. Metanephrine. PSA. Taux de sédimentation. Creatinine. Leucocytes.
Existence d’une biothèque Oui
Contenu de la biothèque Sang total
Cellules sanguines isolées
Tissus
Lignées cellulaires
ADN
ADNc/ARNm
Autres
Détail des éléments conservés Echantillons tumoraux
Paramètres de santé étudiés Evénements de santé/morbidité
Evénements de santé/mortalité
Modalités
Suivi des participants Oui
Appariement avec des sources administratives Non
Valorisation et accès
Valorisation et accès
Lien vers le document http://cit.ligue-cancer.net/?page_id
Accès
Charte d'accès aux données (convention de mise à disposition, format de données et délais de mise à disposition) L’accès aux données est sécurisé, et restreint pour chaque projet aux investigateurs concernés.
Accès aux données agrégées Accès restreint sur projet spécifique
Accès aux données individuelles Accès restreint sur projet spécifique

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