3LABOS - To Improve Infectious Disease Surveillance in France by Automated Biological Data Extraction from 3 Laboratories

Responsable(s) :
Dubois Daniel

Date de modification : 07/07/2015 | Version : 1 | ID : 8403

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Général
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Nom détaillé To Improve Infectious Disease Surveillance in France by Automated Biological Data Extraction from 3 Laboratories
Sigle ou acronyme 3LABOS
Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.) 1415428 v0
Thématiques générales
Domaine médical Biology
Infectious diseases
Mots-clés infectious diseases, laboratory test data, automated extraction, surveillance
Responsable(s) scientifique(s)
Nom du responsable Dubois
Prénom Daniel
Adresse 12 Rue du Val d’Osne, 94415 Saint-Maurice
Email DMI@invs.sante.fr
Organisme Institut de veille
Collaborations
Financements
Financements Public
Précisions French Institute for Public Health Surveillance (InVS)
Gouvernance de la base de données
Organisation(s) responsable(s) ou promoteur InVS
Statut de l’organisation Secteur Public
Contact(s) supplémentaire(s)
Caractéristiques
Type de base de données
Type de base de données Study databases
Base de données issues d'enquêtes, précisions Longitudinal study (except cohorts)
Origine du recrutement des participants A selection of health institutions and services
Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle No
Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon Patients fulfilling the exclusion criteria.
Objectif de la base de données
Objectif principal Surveillance of infectious diseases through regular automated transfer of biological results from specialist biology laboratories to InVS.

To improve the surveillance of certain infectious diseases already monitored by another system:
o To supplement surveillance data from other sources and to estimate completeness (particularly MDO).

• To implement a sustainable monitoring system for unmonitored diseases as well as:
o Monitoring spatial and temporal trends of targeted pathogens;
o Providing individual data;
o Contributing to epidemic investigations;
o Identifying active movement areas.
Critères d'inclusion Individuals who have had biological samples taken for the following diseases: measles, chikungunya, dengue fever, tuberculosis, syphilis, Q fever, tick-borne encephalitis, leptospirosis, Lyme disease, psittacosis, toxoplasmosis. (CNIL file in progress for: hepatitis E, hepatitis A, rubella, lead poisoning, gonorrhoea and chlamydia).
Type de population
Age Newborns (birth to 28 days)
Infant (28 days to 2 years)
Early childhood (2 to 5 years)
Childhood (6 to 13 years)
Adolescence (13 to 18 years)
Adulthood (19 to 24 years)
Adulthood (25 to 44 years)
Adulthood (45 to 64 years)
Elderly (65 to 79 years)
Great age (80 years and more)
Population concernée General population
Sexe Male
Woman
Champ géographique National
Détail du champ géographique France
Collecte
Dates
Année du premier recueil 2012
Taille de la base de données
Taille de la base de données (en nombre d'individus) Greater than 20 000 individuals
Détail du nombre d'individus ---
Données
Activité de la base Current data collection
Type de données recueillies Biological data
Administrative data
Données biologiques, précisions Lab name, disease, laboratory test results: serology tests, CRP, etc. according to disease.
Données administratives, précisions Patient data: anonymity code, date of birth, sex, post code, sample identifier. Laboratory: company name, address, post code, municipality, phone. Prescriber: surname, first name, address, post code, municipality, phone.
Existence d’une biothèque No
Paramètres de santé étudiés Health care consumption and services
Others
Consommation de soins, précisions Medical/paramedical consultation
Autres, précisions Biological test results.
Modalités
Mode de recueil des données Automated data extraction from 3 laboratories to InVS. Receipt of files per laboratory and disease at determined intervals (daily or monthly).
Procédures qualité utilisées Consistency controls during data transmission, statistical programmes.
Suivi des participants Yes
Détail du suivi Improved surveillance and investigations may be implemented for positive cases in relation to regional InVS units (CIREs), according to the monitored disease.
Appariement avec des sources administratives Yes
Sources administratives appariées, précisions The individual anonymity code from the 3Labos database is the same code used for obligatory notification.
Valorisation et accès
Valorisation et accès
Accès
Charte d'accès aux données (convention de mise à disposition, format de données et délais de mise à disposition) Contact the scientist in charge/Send data request form to InVS.

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