NOSO-COR-IMMUNO - Multicenter study on nosocomial transmission of SARS-CoV2 virus - Ancillary study of NOSO-COR Project

Responsable(s) :
VANHEMS PHILIPPE, Laboratoire des Pathogènes Emergents / Service Hygiène, Epidémiologie, Infectiologie et Prévention

Date de modification : 22/09/2021 | Version : 1 | ID : 73994

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Général
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Nom détaillé Multicenter study on nosocomial transmission of SARS-CoV2 virus - Ancillary study of NOSO-COR Project
Sigle ou acronyme NOSO-COR-IMMUNO
Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.) 2020-A02128-31
Thématiques générales
Domaine médical Maladies infectieuses
Etude en lien avec la Covid-19 Oui
Pathologie, précisions Réponse immunitaire à 9 mois et 12 mois de l'infection
Déterminants de santé Systèmes de soins et accès aux soins
Responsable(s) scientifique(s)
Nom du responsable VANHEMS
Prénom PHILIPPE
Adresse Laboratoire des Pathogènes Emergents, Fondation Mérieux, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), INSERM U1111, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, UCBL1, Lyon, France
And,
Centre Hospitalier Hôpital Edouard Herriot – Hospices Civils de Lyon
Service Hygiène, Epidémiologie et Prévention
5 Place d'Arsonval, 69003 Lyon, France
Téléphone 04 72 11 07 20
Email philippe.vanhems@chu-lyon.fr
Laboratoire Laboratoire des Pathogènes Emergents / Service Hygiène, Epidémiologie, Infectiologie et Prévention
Organisme Fondation Mérieux, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), INSERM U1111, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, UCBL1, Lyon, France / Hospices Civils de Lyon,
Collaborations
Participation à des projets, des réseaux, des consortiums Non
Financements
Gouvernance de la base de données
Organisation(s) responsable(s) ou promoteur Hospices Civils de Lyon
Statut de l’organisation Secteur Public
Existence de comités scientifique ou de pilotage Non
Contact(s) supplémentaire(s)
Caractéristiques
Type de base de données
Type de base de données Bases de données issues d’enquêtes
Origine du recrutement des participants Via une sélection de services ou établissements de santé
Critère de sélection des participants Autre traitement ou procédure
Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle Oui
Précisions Intervention au niveau individuel
Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon Les patients inclus dans l'étude NOSO-COR project aux Hospices Civils de Lyon ont été contactés afin de leur proposer de participer à cette étude.
Objectif de la base de données
Objectif principal Le principal objectif de cette étude ancillaire est de décrire la réponse sérologique chez les personnes infectées par SARS-CoV-2 à distance de l’épisode infectieux.

Objectifs secondaires :
1. Caractérisation des populations T CD8 spécifiques du virus, phénotype et capacité fonctionnelle, présente dans la circulation (PBL)
2. Titration des anticorps neutralisants vs. facilitateurs
3. Comparaison des caractéristiques de la réponse immune mémoire des patients
4. Etude de la restauration immunitaire post-COVID19
5. Constitution d'une collection d'échantillons biologiques salivaires et sanguins aux HCL (serum et les cellules mononuclées du sang périphérique (PBMC)) et cession d'une partie des produits sanguins avant la fin de la recherche au Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI) pour initier des recherches pour de nouvelles connaissances scientifiques sur les agents pathogène SARS-CoV-2.
Critères d'inclusion • Personnes inclues dans l’étude NOSO-COR présentant un diagnostic de COVID-19 confirmé par un test biologique RT-PCR sur écouvillon nasopharyngé spécifique pour le virus SARS-CoV-2
• Personnes majeures
• Personnes qui ont été dûment informées et qui ont signé le formulaire de consentement éclairé de l’étude ancillaire
• Personnes affiliées à un régime de sécurité sociale
Type de population
Age Adulte (25 à 44 ans)
Adulte (45 à 64 ans)
Personnes âgées (65 à 79 ans)
Grand âge (80 ans et plus)
Population concernée Sujets malades
Pathologie I - Certaines maladies infectieuses et parasitaires
Sexe Masculin
Féminin
Champ géographique Régional
Régions concernées par la base de données Auvergne Rhône-Alpes
Détail du champ géographique Patients hospitalisés aux Hospices Civils de Lyon
Collecte
Dates
Année du premier recueil 2020
Année du dernier recueil 2021
Taille de la base de données
Taille de la base de données (en nombre d'individus) < 500 individus
Détail du nombre d'individus 189
Données
Type de données recueillies Données cliniques
Données déclaratives
Données paracliniques
Données biologiques
Données cliniques, précisions Dossier clinique
Examen médical
Détail des données cliniques recueillies Données de la base NOSO-COR
Données déclaratives, précisions Face à face
Détail des données déclaratives recueillies symptômes persistant, nouveaux symptômes, nouvelle hospitalisation, nouveau test PCR, cas contact, vaccination anti-grippale et anti-COVID-19
Données paracliniques, précisions données démographiques
Données biologiques, précisions Sérologie, PCR
Existence d’une biothèque Oui
Contenu de la biothèque Sérum
Cellules sanguines isolées
Cellules buccales
Détail des éléments conservés PBMC, salive
Paramètres de santé étudiés Autres
Autres, précisions réponse immunitaire
Modalités
Mode de recueil des données Etude interventionnelle. Les sujets participant à l’étude NOSO-COR au sein des Hospices Civils de Lyon et ayant été diagnostiqués du COVID-19 ont été invités à participer. Deux visites ont été programmées à environ 8 et 12 mois (± 1 mois) après l’épisode infectieux initial par SARS-CoV-2. Ces visites consistaient en: la présentation de l’étude ancillaire, la signature du consentement, la réalisation des prélèvements sanguins, salivaire et nasopharyngé à chaque visite dans un centre de prélèvement des HCL.
Procédures qualité utilisées Données récoltées par les médecins en face-à-face, saisie par l'équipe d'épidémiologie du Pr Vanhems dans un e-CRF créé par les data mangers des HCL. Données analysées par l'équipe des biostatisticiens des HCL.
Suivi des participants Oui
Modalités de suivi des participants Suivi par convocation du participant
Détail du suivi Convacation à environ 8 mois et 12 mois de leur épisode infectieux.
Appariement avec des sources administratives Non
Valorisation et accès
Valorisation et accès
Accès
Existence d’un document qui répertorie les variables et les modalités de codage Oui
Accès aux données individuelles Accès restreint sur projet spécifique

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