Cohorte sur la génomique de la résistance/susceptibilité face à l'infection par VIH-1 / Portail Epidemiologie - France

ITMO Santé Publique Aviesan

Fiches Cohorte sur la génomique de...

Partenaires - F.A.Q. - Contact - Plan du site - Mentions légales - Administration - PEF-HD - Mis à jour le 15 décembre 2020 - Version 4.10.05

Général
Identification
Nom détaillé	Cohorte sur la génomique de la résistance/susceptibilité face à l'infection par VIH-1
Sigle ou acronyme	GRIV
Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.)	Accord CNIL : 10/04/1995
Thématiques générales
Domaine médical	Biologie Maladies infectieuses
Déterminants de santé	Génétique
Mots-clés	taux de lymphocytes cd4+, non progresseurs, charge virale, évènements cliniques, déclenchement rapide, séroconversion documentée, événements de santé, séropositivité, suivi
Responsable(s) scientifique(s)
Nom du responsable	Zagury
Prénom	Jean-Francois
Adresse	75003 PARIS
Email	zagury@cnam.fr
Laboratoire	CHAIRE DE BIOINFORMATIQUE CNAMLaboratoire de physiologie cellulaire
Organisme	CNAM
Collaborations
Participation à des projets, des réseaux, des consortiums	Oui
Précisions	Implication dans un réseau de cohorte : Cohortes SIDA liées à l'Agence Nationale de la Recherche sur le SIDA et les Hépatites (ANRS) dans le cadre du consortium de Génomique du SIDA de l'ANRS
Financements
Financements	Publique
Précisions	SIDACTION, ANRS, Ministère de l'Education, de la Recherche et de la Technologie
Gouvernance de la base de données
Organisation(s) responsable(s) ou promoteur	CHAIRE DE BIOINFORMATIQUE CNAM
Statut de l’organisation	Secteur Public
Contact(s) supplémentaire(s)
Caractéristiques
Type de base de données
Type de base de données	Bases de données issues d’enquêtes
Base de données issues d'enquêtes, précisions	Etudes de cohortes
Origine du recrutement des participants	Via une sélection de services ou établissements de santé
Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle	Non
Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon	Rétrospectif
Objectif de la base de données
Objectif principal	Objectif général : déterminer les polymorphismes (variations) génétiques qui favorisent/défavorisent l'infection et/ou la progression vers le Sida. Objectif secondaire : comprendre les mécanismes moléculaires de pathogenèse de l'infection par VIH-1 et en conséquence, développement rationnel de nouvelles stratégies thérapeutiques ou diagnostiques.
Critères d'inclusion	Sujets non progresseurs : sujets séropositifs depuis plus de 8 ans sans signes cliniques,sans traitement, et avec des taux de lymphocytes cd4+ supérieurs à 500/mm3 Sujets progresseurs rapides : sujets dont le taux de lymphocytes cd4+ a chuté sous 300/mm3 moins de 3 ans après la séroconversion
Type de population
Age	Adulte (19 à 24 ans) Adulte (25 à 44 ans) Adulte (45 à 64 ans)
Population concernée	Sujets malades
Sexe	Masculin Féminin
Champ géographique	National
Détail du champ géographique	Cohorte multicentrique française
Collecte
Dates
Année du premier recueil	09/1995
Taille de la base de données
Taille de la base de données (en nombre d'individus)	< 500 individus
Détail du nombre d'individus	400
Données
Activité de la base	Collecte des données terminée
Type de données recueillies	Données cliniques Données déclaratives Données biologiques
Données cliniques, précisions	Dossier clinique Examen médical
Détail des données cliniques recueillies	Examen clinique à l’inclusion Informations recueillies lors de l'examen clinique : symptômes liés au sida
Données déclaratives, précisions	Face à face
Détail des données déclaratives recueillies	Questionnaire par entretien à l’inclusion Informations recueillies lors de l'entretien : date de naissance, sexe, mode de contamination, date présumée, première date de séropositivité documentée, dernière date de séronégativité documentée, passé clinique, bilans biologiques notamment hématologiques
Données biologiques, précisions	Type de prélèvements réalisés : 4 tubes de sang
Existence d’une biothèque	Oui
Contenu de la biothèque	Sérum ADN
Détail des éléments conservés	Sérothèque, DNAthèque
Paramètres de santé étudiés	Evénements de santé/morbidité Evénements de santé/mortalité
Modalités
Mode de recueil des données	Entretiens : saisie à partir d’un questionnaire papier (saisie manuelle) avec double saisie Examens cliniques : étape manuscrite avec double saisie Examens biologiques : étape manuscrite avec double saisie
Procédures qualité utilisées	Présence d'une requête de cohérence après la saisie des données informatiques Gestion des données manquantes par retour au dossier source et/ou retour vers un tiersAutre(s) procédure(s) qualité : contacts réguliers avec les médecins traitants sur la durée du suivi prévu Les patients sont informés de l'utilisation de leur données
Suivi des participants	Oui
Détail du suivi	Durée indéterminée
Appariement avec des sources administratives	Non
Valorisation et accès
Valorisation et accès
Lien vers le document	http://tinyurl.com/HAL-GRIV
Description	Liste des publications dans HAL
Lien vers le document	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=GRIV+AND+Zagury[Author]
Description	Liste des publications dans Pubmed
Accès
Charte d'accès aux données (convention de mise à disposition, format de données et délais de mise à disposition)	Utilisation possible des données par des équipes académiques Condition d'accès collaboration avec d'autres équipes travaillant sur le même thème de génomique du sida. Utilisation possible des données par des industriels : à déterminer
Accès aux données agrégées	Accès restreint sur projet spécifique
Accès aux données individuelles	Accès restreint sur projet spécifique

GRIV - Cohorte sur la génomique de la résistance/susceptibilité face à l'infection par VIH-1

Exporter au format XML

Exporter au format CSV

Général

Caractéristiques

Collecte

Valorisation et accès

XXX