ERAES - Etude longitudinale en Guyane: "Écologie de la résistance aux antibiotiques de Escherichia coli et Staphylococcus aureus dans les flores commensales"
Responsable(s) :
Andremont Antoine, EA 6934 RÉSISTANCE BACTÉRIENNE IN VIVO
Date de modification : 27/08/2015 | Version : 2 | ID : 60128
| Général | |
| Identification | |
| Nom détaillé | Etude longitudinale en Guyane: "Écologie de la résistance aux antibiotiques de Escherichia coli et Staphylococcus aureus dans les flores commensales" |
| Sigle ou acronyme | ERAES |
| Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.) | -- |
| Thématiques générales | |
| Domaine médical |
Maladies infectieuses |
| Déterminants de santé |
Produits de santé |
| Mots-clés | effet, antibiotiques, microorganismes, bactéries cibles et levures, flores commensales, écologie, dissémination, événements de santé, prescriptions, évolution, environnement |
| Responsable(s) scientifique(s) | |
| Nom du responsable | Andremont |
| Prénom | Antoine |
| Adresse | 75018 PARIS |
| antoine.andremont@bch.aphp.fr | |
| Laboratoire | EA 6934 RÉSISTANCE BACTÉRIENNE IN VIVO |
| Organisme | UNIVERSITÉ PARIS |
| Collaborations | |
| Participation à des projets, des réseaux, des consortiums |
Oui |
| Précisions | Implication dans un réseau de cohorte : ni le projet ERAES ni la cohorte ne font partie d'un réseau européen. Les membres du consortium sont tous français. Néanmoins, une équipe néerlandaise (PR. A. VAN BELKUM, UNIVERSITE ERASME) est associée au projet en raison de ces compétences scientifiques pour l'analyse en aveugle du polymorphisme de l'ADN des amérindiens inclus dans la cohortes. Cette association et ses modalités ont reçu l'accord du CPP de Bordeaux. |
| Financements | |
| Financements |
Publique |
| Précisions | ANR, AFSSET, Inserm |
| Gouvernance de la base de données | |
| Organisation(s) responsable(s) ou promoteur | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale |
| Statut de l’organisation |
Secteur Public |
| Contact(s) supplémentaire(s) | |
| Caractéristiques | |
| Type de base de données | |
| Type de base de données |
Bases de données issues d’enquêtes |
| Base de données issues d'enquêtes, précisions |
Etudes longitudinales (hors cohortes) |
| Origine du recrutement des participants |
Via un fichier de population |
| Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle |
Non |
| Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon | Rétrospectif Autres organismes actifs dans la constitution de la cohorte : CHU, CHG, amérindiens wayampis résidants à trois sauts (sauf guyane) déjà inclus dans le projet ERAES AMERINDIENS. |
| Objectif de la base de données | |
| Objectif principal |
Objectif général : surveiller l’évolution de la résistance bactérienne et de la colonisation à levures dans les flores commensales d’une cohorte de 157 amérindiens vivants à Trois-Sauts au moment d’une transition culturelle rapide.
Objectif secondaire : mesurer l’évolution de l’impact sur la résistance bactérienne et la colonisation à levures dans l’environnement (animaux, sols, eaux) au cours de la même période. |
| Critères d'inclusion | Adultes résidant en Guyane |
| Type de population | |
| Age |
Adulte (19 à 24 ans) Adulte (25 à 44 ans) Adulte (45 à 64 ans) |
| Population concernée |
Population générale |
| Sexe |
Masculin Féminin |
| Champ géographique |
Départemental |
| Régions concernées par la base de données |
Guyane |
| Détail du champ géographique | Guyane |
| Collecte | |
| Dates | |
| Année du premier recueil | 10/2006 |
| Année du dernier recueil | 06/2012 |
| Taille de la base de données | |
| Taille de la base de données (en nombre d'individus) |
< 500 individus |
| Détail du nombre d'individus | 165 |
| Données | |
| Activité de la base |
Collecte des données active |
| Type de données recueillies |
Données cliniques Données biologiques |
| Données cliniques, précisions |
Dossier clinique Examen médical |
| Détail des données cliniques recueillies | Examen clinique à l’inclusion et au cours du suivi.Informations recueillies lors de l'examen clinique : consommation antibiotique - mode de vie - événements médicaux. renseignés par l'infirmier en poste a trois-sauts, ou le chef de village |
| Données biologiques, précisions | Type de prélèvements réalisés : -selles, écouvillon nasal, salive. |
| Existence d’une biothèque |
Oui |
| Contenu de la biothèque |
Cellules sanguines isolées ADN |
| Détail des éléments conservés | DNAthèque, collection de souches bactériennes |
| Paramètres de santé étudiés |
Evénements de santé/morbidité Evénements de santé/mortalité |
| Modalités | |
| Mode de recueil des données | Entretiens : saisie à partir d’un questionnaire papier Examens biologiques : étape manuscrite |
| Procédures qualité utilisées | Présence d'une requête de cohérence après la saisie des données informatiques Gestion des données manquantes par retour vers un tiersRelance des sujets pour réaliser les visites de suiviRéalisation d'audits qualité internes à chaque campagne de prélèvements Les patients sont informés de l'utilisation de leur données |
| Suivi des participants |
Oui |
| Détail du suivi | 18 mois / 2 ans |
| Appariement avec des sources administratives |
Oui |
| Sources administratives appariées, précisions | Précisions sur base(s) de données utilisée(s) : carnets de santé des habitants du village conservés au poste de santé |
| Valorisation et accès | |
| Valorisation et accès | |
| Lien vers le document | http://tinyurl.com/PUBMED-ERAES |
| Description | Liste des publications dans Pubmed |
| Accès | |
| Charte d'accès aux données (convention de mise à disposition, format de données et délais de mise à disposition) |
Utilisation possible des données par des équipes académiques : à déterminer
Condition d'accès l’utilisation des données : sera possible pour des équipes n’appartenant pas au consortium uniquement après soumission de projets et validation par le conseil scientifique de la cohorte. Dans tous les cas ces éventuelles analyses complémentaires sur des prélèvements stockes seront réalisées après accord du CPP saisi par le comité scientifique de la cohorte et dans le respect strict de l’anonymat des participants. Utilisation non possible des données par des industriels |
| Accès aux données agrégées |
Accès restreint sur projet spécifique |
| Accès aux données individuelles |
Accès restreint sur projet spécifique |
