GRIV - Cohorte sur la génomique de la résistance/susceptibilité face à l'infection par VIH-1
Responsable(s) :
Zagury Jean-Francois, CHAIRE DE BIOINFORMATIQUE CNAMLaboratoire de physiologie cellulaire
Date de modification : 21/07/2015 | Version : 2 | ID : 60149
| Général | |
| Identification | |
| Nom détaillé | Cohorte sur la génomique de la résistance/susceptibilité face à l'infection par VIH-1 |
| Sigle ou acronyme | GRIV |
| Numéro d'enregistrement (ID-RCB ou EUDRACT, CNIL, CPP, etc.) | Accord CNIL : 10/04/1995 |
| Thématiques générales | |
| Domaine médical |
Biologie Maladies infectieuses |
| Déterminants de santé |
Génétique |
| Mots-clés | taux de lymphocytes cd4+, non progresseurs, charge virale, évènements cliniques, déclenchement rapide, séroconversion documentée, événements de santé, séropositivité, suivi |
| Responsable(s) scientifique(s) | |
| Nom du responsable | Zagury |
| Prénom | Jean-Francois |
| Adresse | 75003 PARIS |
| zagury@cnam.fr | |
| Laboratoire | CHAIRE DE BIOINFORMATIQUE CNAMLaboratoire de physiologie cellulaire |
| Organisme | CNAM |
| Collaborations | |
| Participation à des projets, des réseaux, des consortiums |
Oui |
| Précisions | Implication dans un réseau de cohorte : Cohortes SIDA liées à l'Agence Nationale de la Recherche sur le SIDA et les Hépatites (ANRS) dans le cadre du consortium de Génomique du SIDA de l'ANRS |
| Financements | |
| Financements |
Publique |
| Précisions | SIDACTION, ANRS, Ministère de l'Education, de la Recherche et de la Technologie |
| Gouvernance de la base de données | |
| Organisation(s) responsable(s) ou promoteur | CHAIRE DE BIOINFORMATIQUE CNAM |
| Statut de l’organisation |
Secteur Public |
| Contact(s) supplémentaire(s) | |
| Caractéristiques | |
| Type de base de données | |
| Type de base de données |
Bases de données issues d’enquêtes |
| Base de données issues d'enquêtes, précisions |
Etudes de cohortes |
| Origine du recrutement des participants |
Via une sélection de services ou établissements de santé |
| Le recrutement dans la base de données s'effectue dans le cadre d'une étude interventionnelle |
Non |
| Informations complémentaires concernant la constitution de l'échantillon | Rétrospectif |
| Objectif de la base de données | |
| Objectif principal |
Objectif général : déterminer les polymorphismes (variations) génétiques qui favorisent/défavorisent l'infection et/ou la progression vers le Sida.
Objectif secondaire : comprendre les mécanismes moléculaires de pathogenèse de l'infection par VIH-1 et en conséquence, développement rationnel de nouvelles stratégies thérapeutiques ou diagnostiques. |
| Critères d'inclusion |
Sujets non progresseurs : sujets séropositifs depuis plus de 8 ans sans signes cliniques,sans traitement, et avec des taux de lymphocytes cd4+ supérieurs à 500/mm3
Sujets progresseurs rapides : sujets dont le taux de lymphocytes cd4+ a chuté sous 300/mm3 moins de 3 ans après la séroconversion |
| Type de population | |
| Age |
Adulte (19 à 24 ans) Adulte (25 à 44 ans) Adulte (45 à 64 ans) |
| Population concernée |
Sujets malades |
| Sexe |
Masculin Féminin |
| Champ géographique |
National |
| Détail du champ géographique | Cohorte multicentrique française |
| Collecte | |
| Dates | |
| Année du premier recueil | 09/1995 |
| Taille de la base de données | |
| Taille de la base de données (en nombre d'individus) |
< 500 individus |
| Détail du nombre d'individus | 400 |
| Données | |
| Activité de la base |
Collecte des données terminée |
| Type de données recueillies |
Données cliniques Données déclaratives Données biologiques |
| Données cliniques, précisions |
Dossier clinique Examen médical |
| Détail des données cliniques recueillies | Examen clinique à l’inclusion Informations recueillies lors de l'examen clinique : symptômes liés au sida |
| Données déclaratives, précisions |
Face à face |
| Détail des données déclaratives recueillies | Questionnaire par entretien à l’inclusion Informations recueillies lors de l'entretien : date de naissance, sexe, mode de contamination, date présumée, première date de séropositivité documentée, dernière date de séronégativité documentée, passé clinique, bilans biologiques notamment hématologiques |
| Données biologiques, précisions | Type de prélèvements réalisés : 4 tubes de sang |
| Existence d’une biothèque |
Oui |
| Contenu de la biothèque |
Sérum ADN |
| Détail des éléments conservés | Sérothèque, DNAthèque |
| Paramètres de santé étudiés |
Evénements de santé/morbidité Evénements de santé/mortalité |
| Modalités | |
| Mode de recueil des données | Entretiens : saisie à partir d’un questionnaire papier (saisie manuelle) avec double saisie Examens cliniques : étape manuscrite avec double saisie Examens biologiques : étape manuscrite avec double saisie |
| Procédures qualité utilisées | Présence d'une requête de cohérence après la saisie des données informatiques Gestion des données manquantes par retour au dossier source et/ou retour vers un tiersAutre(s) procédure(s) qualité : contacts réguliers avec les médecins traitants sur la durée du suivi prévu Les patients sont informés de l'utilisation de leur données |
| Suivi des participants |
Oui |
| Détail du suivi | Durée indéterminée |
| Appariement avec des sources administratives |
Non |
| Valorisation et accès | |
| Valorisation et accès | |
| Lien vers le document | http://tinyurl.com/HAL-GRIV |
| Description | Liste des publications dans HAL |
| Lien vers le document | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=GRIV+AND+Zagury[Author] |
| Description | Liste des publications dans Pubmed |
| Accès | |
| Charte d'accès aux données (convention de mise à disposition, format de données et délais de mise à disposition) |
Utilisation possible des données par des équipes académiques
Condition d'accès collaboration avec d'autres équipes travaillant sur le même thème de génomique du sida. Utilisation possible des données par des industriels : à déterminer |
| Accès aux données agrégées |
Accès restreint sur projet spécifique |
| Accès aux données individuelles |
Accès restreint sur projet spécifique |
